明军大规模的进驻，使因为战乱而陷入混乱的朝鲜逐步恢复了秩序，，，
而咸镜道的旗本武士，在松下神将的劝降下，陆续投降，，然而由于咸镜道本土官员裹挟着本地治安军发起骚乱，
使得咸镜道陷入了长达半月的混乱，黑云龙当机立断，命令投降日军与京营士兵共同镇压咸镜道的治安军，，
经过血腥杀戮，最终使得咸镜道官吏百姓臣服。
当松下带着咸镜道的一万武士回到黄海道时，
明军已经大军云集在了黄海道，
而此时的孙传庭直接下令屠杀一万咸镜道的旗本武士，手无寸铁的倭国旗本武士大吃一惊。
而更让人无法接受的是，处决投降武士的任务被交到了松下手里，，
松下以及十几个大名此时都彻底傻眼，
他们被要求对投降的一万同胞下手。
＂孙将军，我们要见大明皇帝陛下！武士们已经投降你们不能这样对待他们！＂松下愤怒的说道。
＂松下将军，我有必要提醒你，我不是在跟你商量，如果你们不处决咸镜道归来的这一万武士，那么你们也将是大明的敌人，而不是朋友！＂孙传庭说道。
松下震惊的说不出话来，
孙传庭威胁的意味非常明显，，
要不然松下带着藩国这三千武士屠杀一万投降的旗本武士，
要么就这一万三千人一起被明军处决！
最终松下含泪下了命令。
屠杀整整从早上进行到夜晚，，，，明军早已经挖好的深坑成了一万投降武士的最终归宿，，，
而手刃同胞的这三千武士，成了此次朝鲜战争最后幸存的倭人。
至此，，朝鲜本土的战争行动基本告一段落。长达一个多月的倭乱也彻底告一段落。
经过此战，倭国彻底失去了再次入侵朝鲜的能力，，而朝鲜王室官僚本土势力也遭到了巨大的损失。明军真正意义完全实现了对朝鲜的占领。
朝鲜的重建工作紧锣密鼓的进行，各地府城的重建工作也正式展开，因为战乱各处逃亡的朝鲜百姓也陆续回到了乡土开始重建家园。