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古经有纪：昔太古洪荒末，人、巫、妖，三族争于世，巫妖二族死战而亡，人族应燧皇之领，大兴天地。
洪荒之中不计年，岁月流逝，转眼已经过去了千万年岁月，人族在有巢氏、缁衣氏、太昊氏、九头氏、太康氏、少康氏、少昊氏以及神农氏八大祖老的带领之下，日渐繁盛，渐至大兴。
更有赤松子、后羿、风后、雨伯、盘王、神龙、吉伯、吴忠义、十二元辰、孔宣、擎天、赤尻马猴等诸多强者相助，扫荡巫妖二族，将之残部，尽数逼入北俱芦洲这等险恶之地，苟延残喘。
大势将定，各方太古大尊并不在意，但新晋的诸天圣人，却对人族一支独大暗暗不满，明里暗里，不知动了多少手段。
先是妖族大圣伏羲转世，进入人族，自少昊氏手中继承人王之位，以洛书河图为参研，悟出先天伏羲八卦！
后三清、女娲、准提、接引妄图册封人皇，有巢氏、缁衣氏、太昊氏、赤松子、后羿等人族强者奋力反抗，幸得有巢氏、缁衣氏二人及时突破极限，达到混元大罗金仙境界，才得以抗衡诸天圣人，为人族争得自立之机。
伏羲未免女娲与人族难堪、乃至交恶，自斩妖族过往，彻底蜕变为人，人族方始认同，许他接掌共主之位，但不为人王，不为祖老。
于是，十余万年岁月过去，伏羲氏退位之后，隐居火云洞中，自此潜修。不再过问天地之间的诸般事物，便连自己的妹妹女娲也不多见了。
伏羲氏后，神农继位，称为新一任的共主，他改良五谷、尝百草。为人族立下汗马功劳，德行足以动天，万年之后，为人族认可，入住人祖殿，称为人族第九位祖老。
自此。人族彻底大兴，但世间轮回，盛极而衰，早有定数。
却说，有熊族轩辕自幼拜入阐教十二金仙之首广成子的门下。二十年世间，不仅修得仙人之身，更学得文武兼济，有治理天下之才。神农氏退位之前，闻其才能，又加以考验，遂将共主之位传于轩辕，自己则往人祖殿接任祖老之位。
轩辕初为共主。年轻气胜，经验不足，凡有不服法制者。常起兵攻伐。终于，引得北方一大族不满。
自水火二神争帝大战之后，圣人现世，西方接引、准提占据西方，三清占据东方及四海。巫妖二族为族人征伐，日渐式微。妖族大多遁入深山老林，巫族则退守极北祖巫殿。
有少许巫族与人族混居。在北方建了一个大部落，名唤九黎。却有上古大巫重山不甘昔日之败。以轮回秘法转世，化为九黎族人，名号蚩尤，修行巫族玄功，炼成了巫神不死之身，强悍无比。
蚩尤就任九黎族族长，对轩辕十分不满，与其八十一个兄弟一起带领九黎族勇士起兵造反，与轩辕决战于逐鹿平原。
九黎族人大多是巫族与人族混生而成，各个凶悍，实力远非普通人族可比，蚩尤大军一路开来，连连攻破数个人族大部落，所破小部落更是多达数十个之多。
其间，九黎族大军实力日渐壮大，蚩尤旗下，更有雷王、火蜈等昔年巫族成名大巫。轩辕大军根本抵挡不住，纵有广成子、云中子等阐教金仙相助，却还是节节败退。
此时，三十三重天庭乃是由道祖鸿钧座下童子旱天、瑶池执掌，二人曾为道祖童子，修为高深莫测，加上背后有道祖撑腰，坐镇天庭以来，诸界俱服，虽然没有什么大的作为，却也一直没什么大乱发生。
轩辕乃是神农氏亲传、诸天仙神共立的人皇，蚩尤公然反叛，第一个丢面皮的就是天庭之主。于是，昊天、瑶池命九天玄女并十万天兵天将下凡，助轩辕抵抗九黎族大军。
原本，蚩尤的大军占了很大的优势，几乎是势若破竹，但天庭的意外介入，以天兵砥柱了蚩尤的大军，却是令双方陷入了对峙之中，开启了长达数十年之久的人族第一内战：逐鹿之争！
轩辕毕竟得上天眷顾，人祖庇佑，蚩尤虽猛，奈何终究有着一些巫族血脉，并不纯正，逐鹿大战到了最后，轩辕得到人祖殿赐下神兵轩辕神剑，在诸天仙神的帮助之下，一举击败了蚩尤，彻底奠定了自己的人皇尊位。