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辽东的战事在三日后打响，张献忠过了山海关，吴三桂渡过鸭绿江，两军集合之后，迅速的向辽东扩张，辽东的满洲人早就听到了河北地区的战事结果，也知道汉家军“留辨去头，留头去辫！”的政策，开始的确是奋死抵抗，但是吴三桂与张献忠是什么人？张献忠在四川之时屠杀了多少人？那是还是对汉人自己呢，如今对付满洲更是肆无忌惮，而吴三桂在东瀛之时，将整个东瀛几乎毁之一旦，东瀛本地人口急剧下降，也全都是吴三桂的“功劳”，沐临风之所以用这两个人，无非也就是想以杀止杀，以暴治暴罢了，不想着两人各怀鬼胎，却迟迟不能出兵，如今天下战事只剩那辽东一块了，他俩如何能再不卖力，有这两个“猛将”，虽然多尔衮骁勇善战，沐临风也不忌惮。
比之辽东的战事，沐临风现在首要的任务是整顿内务，先是迁都，北京自明成祖朱棣开始就一直是首都，南京一直是作为陪都存在的，之前是因为北京被满洲占领了，如今北京已经收复，那么北京作为首都也是理所当然的，必须提上议程了。
但是迁都事大，也不是沐临风一句话所能解决的，还有好多相关事宜，必须与南京的那些官员们商议，沐临风即可调任天津水军都统为临时北京禁卫军统领，在自己离京期间负责京城的安稳，随即又急调洪承畴来北京，坐镇北京，总理辽东战事后，自己才放心的回了南京。
这一次回南京，沐临风带上了大玉儿与福林，福林至今没有说一句话，沐临风清楚福林的性子，本来也就是内向无语的，既然大玉儿决定了放弃以前，以后一心一意的跟着沐临风，那么福林也就等于将会是沐临风的儿子了，大玉儿几次三番地让福林叫沐临风为爹，福林都没有叫出口，直到离京前一天，这才勉强叫了一声“阿玛”，沐临风点了点头，虽然不敢保证自己能视福林为己出，但是至少也不会亏待他，以沐临风对福林的性格了解，这一个满清唯一一个不愿意做皇帝的皇帝，所以即便留着他，只怕日后也不会有什么威胁。
德川家惠与田川美子对福林要比沐临风对他还好，毕竟作为女人，她们更清楚孩子想要什么，心里在想什么，大玉儿见德川家惠与田川美子如此对自己的孩子，心中自然满是感激，在回南京的路上，自然与两人话语就多了，一些，不想却与德川家惠、田川美子成为了知己。
沐临风还没有回南京，王之桢与史可法率着一众大臣早早就迎在了南京城外三十里处，当沐临风的銮驾到达之时，众臣高呼万岁，一路簇拥着沐临风进了南京城，南京的臣民大多不熟兵法，自然不了解东北战事的内幕，在他们心里都是以为，张献忠与吴三桂无能，当今天子一去，东北的战事就立刻扭转了，不到一个月时间就已经收复了河北一带，辽东的捷报也频频传来，南京的百姓更是对沐临风视作天人，而南京的大臣当中，只怕也只有史可法一人知道其中曲折，不过他也没有说给第二个人听，那写大臣自然也将沐临风视作真命天子。
南京城里的百姓几乎倾巢而出，虽说辽东的战事还没有真正的结束，但是大势已经不可逆转，胜利就在眼前，所有百姓欢天雾地的出来迎沐临风，百姓虽然不懂得什么歌功颂德的词语，但是她们心里也清楚，中原这块土地上，已经近一个世纪没有安稳日子可过了，就不说满洲人的s扰，内地的起义战争，光是那些明朝贪赃枉法的官员，就剥削了这些百姓整整一个世纪，向沐临风创造的这样的盛世，不敢说绝后，但绝对是空前的，试问古往今来，哪一朝的盛世，可以在连连战火中建立的？况且那还刚刚是盛世的开头，百姓虽然不懂得表达心里的想法，但是她们万分地清楚，自己的好日子才刚刚开始。
沐临风坐着龙撵，从北门进南京城开始，就接受着路道两旁的百姓膜拜，沐临风一边保持着笑容，一边向路道两旁的百姓挥手致意，一直到了午门，这才下了龙撵，进了午门，王之桢立刻走到沐临风的身边，想沐临风汇报近日来南京发生的一些事情，在杨宛与三木森的帮助下，已经找到了德川家隆以及暗青会的藏身所，在孔武与陈大寒两员大将的通力合作之下，彻底铲除了暗青会，同时还抓获了冯仁岙，以及查抄了暗青会的家资，陈近南也顺利的救回了。
沐临风听到这里，欣慰的点了点头，这才微微一笑，这么多日子来，这总算也是一件喜事，说明孔武没有看错人，三木森对孔武看来也是动了真情的了，想到孔武也找到了自己的真爱，沐临风如何能不为他开心高兴。
王之桢还禀告道，钟斌已经回南京赴任，史可法仍是安排了南京皇宫锦衣卫统领一职给钟斌，而孔武也在前日已经卸任，与三木森不知所踪。
沐临风听到这里，停住了脚步，看向王之桢良久，心中却在想，孔武与三木森归隐了？这原本是自己想追求的生活啊，不过细想一下，孔武自从跟了自己后，所做的一切，都不是出自自愿的，不过是为了自己与他的结义之情，一直在勉强为之罢了，如今他找到了自己的真爱，离去本也是情理之中的事，不过孔武竟然没有等自己回南京，就离开了，莫非是怕自己鸟尽弓藏？沐临风想到这里，苦苦一笑，随即又想到，也许孔武是担心自己因为不舍，会百般留他，所以才不辞而别吧？事后想想，也许孔武等着自己回南京再来辞行的话，自己也许当真不舍他离去。
想到这里，沐临风也就释怀了，每个人都有权利追求自己想要的生活，孔武也不例外，孔武如今找到了自己的真爱，追求自己的生活去了，那么自己呢，自己在追求什么？
沐临风进了奉天殿，接受百官朝拜后，立刻提出了迁都的议题，因为北京本来就是天下中心，中原首都，所以也不会有什么人反对，只是商议一些迁都的细节，当然了，这些细节问题完全可以交给史可法与王之桢他们去搞。剩下来的时间就是商议一些新部门的成立，除了之前的廉政署、农业部等等，沐临风又按照二十一世纪的政府部门，添设了十几个，突然沐临风的心中想到了一个职业，就是后世的城管，想到这里，沐临风不禁苦笑摇了摇头，暗道，还是别折磨这个时代的百姓了。
在朝议中，沐临风站到王之桢与史可法后面站着一个熟悉的人影，正是自己之前请出山，后来因为吴行南京叛乱一事，又隐居扬州的复社首领张采先生，沐临风本以为张采愿意再度出山，不想张采却是来想沐临风辞行的，张采对沐临风道：“张某昔日一个好友徐弘祖不久前仙逝，留下一些琐碎的日志无人整理……而另外一个好友金采，给一个前人的小说做了一些点评，也在征求老夫的意见……老夫年纪已大，对于朝政之事已经是力不从心，剩下来的时间想就在书丛中度过了，求陛下恩准！”
沐临风听张采如此一说，心中顿时一动，徐弘祖不就是那个中国著名的地理学家、探险家徐霞客么？已经仙逝了？哦，对了，历史上的记载徐霞客是1641年就去世了，如今已经快1643了，之前竟然没有想起这个人，自己还真是无缘相见啊！那个金采也就是日后的金圣叹，他如今点评的书籍也许就是日后被毛爷爷评定为四大名著之一的《水浒传》吧？想到这里，沐临风微微点了点头，对张采道：“既然如此，朕也就不强求张先生了，希望张先生尽快编辑出徐先生的手记……对了，如果有什么资金方面的问题，尽快与王之桢王大人联系，他会鼎力支持你！”张采闻言自然是千恩百谢的退下。
由于张采的一演，沐临风立刻想到了另外一个问题，就是自古文人清贫，这个时代的作家，诗人，都是清苦过日子的，沐临风立刻对王之桢道：“王大人，你立刻筹办一个文学会，要帮助那些有才之士，在他们困难的时候要激励帮助，不要小看小说、演义、戏曲这些东西，这些千百年后，恐怕就是我中华文明不可或缺的文化瑰宝了！”王之桢立刻领命。
几日后，辽东送来战报，吴三桂与张献忠已经收复了辽东，活捉了多尔衮，正在押解回南京，听后沐临风的处置，而也就是在沐临风收到了辽东战报的同时，沐临风发布了一道密令给北京的洪承畴，让他在吴三桂与张献忠回北京交差之时，秘密将二人抓捕，罪名就是他们在辽东的野蛮行为，一并将“留辫不留头，留头不留辫”的政策全部栽赃给二人，让洪承畴秘密将二人处决。
这日，沐临风收到一本书，名字叫《中华圣帝录》，作者竟然就是牛东门，沐临风随手翻了几页，看到开头沐临风就差点喷血，竟然把自己写的与以前的开国君主帝王一样，说自己降生之前，老妈身边围绕着七彩神龙，盘旋数日这才离去，然后自己诞生，沐临风看的不禁连连摇头，苦笑不已，暗想这个结局再如何不堪，也比让他们知道自己来自未来世界要强多了，随即又粗略的翻看了一下，书中将自己写的简直是绝无仅有的神人一般，攻无不克战无不胜……沐临风暗想这也许就是这个时代的主流吧，自己千辛万苦的来改造这个时代，不想这个时代还是如此的迂腐，不过好在让他欣慰的是，这个时代的经济已经发展了，想要一步到位是不容易，自己已经身心疲惫了，这些还是留给后世之君去改善吧。
十五日后，多尔衮押送到南京，沐临风没有去看，也不想去看，对于这些历史人物，沐临风突然已经失去了兴趣，若是以往就听着多尔衮的名字，他也会去看一眼，沐临风只是让史可法监斩，将多尔衮与德川家隆、冯仁岙一起斩杀于南京皇宫前的午门广场，天下百姓无不拍手称快，就连德川家惠也没有因为德川家隆的死，出来找自己理论什么。
又过半月，淮安送来消息，方甲航的第一道铁路已经开始施工，由淮安到扬州，方甲航奏请沐临风与南京的众官员在竣工之日前去淮安试乘火车，而张锡麟的电报工程也初见成效，基本可以运用，但是还需要校队调整。
同时沐临风收到了杨宛送给自己的一封信，说亲眼见到冯仁岙死在刀下，虽不是她亲手所杀，但是亲眼所见，也算是心愿已了，如今她已经离开了南京，说若是有缘日后再见，会将自己的身世之谜告诉沐临风，若是无缘，那就权当自己与沐临风的相遇是一段美好的回忆。
沐临风看完书信，若有所失，杨宛这个神秘女子，最终也没说明白，来的时候很突然，莫名其妙就出现在自己的生命里了，走的时候也是如此，只留了这么一封书信，沐临风怔怔地看着书信良久，这才想起自己委托她照看郑惜玉的事，不过如今要找杨宛，只怕再也不能了，沐临风暗想，看来与郑惜玉再见也十分渺茫了。
沐临风回到南京一个多月，都没有时间回后宫休息，待处理完这些政事后回到后宫，不想自己所有的女人都不在自己的寝宫，沐临风询问了几个太监宫女后，才知道所有的女人都去了朱媄娖的寝宫，沐临风不知道这些女子在搞什么，立刻摆驾而去一探究竟。