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探索舰队下辖的两支分舰队的任务很明确，南下分舰队的任务是探索澳大利亚、新西兰、巴布亚新几内亚、新喀里多尼亚和斐济等地区和岛屿。
太平洋探索分舰队的任务是探索太平洋上的小笠原诸岛、南鸟岛、北马里亚纳群岛、塞班岛、马绍尔群岛、威克岛和夏威夷群岛。
相比之下，太平洋探所分舰队的任务相对繁重了一些，探索的目标不但分散，而且都处于茫茫的太平洋里，在广阔的太平洋中寻找到这些岛屿，难度可想而知。
两支探索分舰队在探索的过程中，主要使用风帆为航行的主要方式。蒸汽动力机组只能当遇到紧急情况下，或是遇到恶劣气候的情况下，才会使用蒸汽动力机组驱动船只。
毕竟舰队远离远东的基地，深入到太平洋的深处，始终要保留着回程的燃煤和水，保证舰队探索过程中的安全。而且探索舰队的成员，登陆后尽量就地取材，争取在当地得到补给。