吴敬梓另作有《木山房集》。程晋芳在《木先生传》中说有「《诗说》若干卷」，惜已失传。</p>
王又曾《书吴征君敏轩先生木山房诗集后有序》：「国初以来重科第，鼎盛最数全椒吴」。</p>
胡适的《吴敬梓年谱》认為吴人并非「装病」，确是因消渴病（类似糖尿病）加剧不得不放弃机会。</p>
胡适：《重印〈木山房集〉序》中说：「我是最敬重吴先生的，常常想蒐求他的遗著，常常痴想他的诗集也许有别保存在世间。」</p>
程晋芳写《木先生传》：「（先生）所著有《木山房集》、《诗说》若干卷；又倣唐人小说為《儒林外史》五十卷，穷极士人情态，人争传写之。」</p>
《儒林外史》长篇小说（也称章回小说），全书共五十六回，约40万字，描写了近二百个人物。小说假託明朝，实际描写了康乾时期科举制度下读书人的功名和生活。</p>
《儒林外史》是直到作者死后十多年，金兆燕官扬州府学教授时，将《儒林外史》刊刻印行，「人争传写之」。这个刻，今已失传。现存最早的刻是嘉庆八年（1803年）鐫刻的卧閒草堂。</p>
现在通行的刻是56回，其中最末一回部份人认定為后人偽作。</p>
晚清名士张虎嗜读《儒林外史》，同治十二年（1873年），张虎以「天目山樵」為名开始评点《儒林外史》。</p>
张虎以為《儒林外史》第三十回杜慎卿厌恶妇人的话出於萧詧事；《儒林外史》第三十六回写孝子郭力赴西川寻父事，张虎以為郭孝子原型為李保泰《嗇生集胡孝子寻亲记》之胡孝子，第三十八回郭孝子喷嚏吓虎则出於《朝野僉载》。</p>
张虎还考出汤奏的原型為吴敬梓的朋友杨凯，荀玫的原型「疑是姓卢」，平步青进一步指明是卢见曾。</p>
《儒林外史》是中国学史上一部杰出的现实主义的长篇讽刺小说。所写内容，假託明季，实為清朝，而且十之的人物都实有其人。</p>
它真实地描绘了康乾时期知识分子生活的沉浮，境遇的顺逆，功名的得失，仕途的升降，情操的高尚与卑劣，理想的倡导与破灭，出路的探索与追寻。</p>
吴敬梓以对待功名富贵的态度来肯定或否定书中人物，如匡超人假造书，冒名代考，却被温州学政「把他题了优行，贡入太学肄业」，严贡生无恶不作，却被前任周学台推举為「优行」；作者无情地鞭挞丑恶事物时，同时也歌颂正面人物，王冕是书中的第一流人物，為人「嶔崎磊落」，庄绍光追求「以礼乐化俗」、「以德化人」，牛老爹和卜老爹也是作者所歌颂的。</p>
程晋芳在《怀人诗》称：「外史记儒林，刻划何工妍；吾為斯人悲，竟以稗史传!」</p>
吴敬梓在《儒林外史》之中，运用朴素、灵活、幽默的地方性的语言，撰写了科举制度的腐朽黑暗，假名士的庸俗不堪，贪官污吏的卑鄙刻薄。胡适形容书：「国家天天掛著孔、孟的招牌，其实不许人说孔、孟的话，也不要人实行孔、孟的教训，只要人念八股，做试帖诗；其餘的『行出处』都可以不讲究，讲究了又『那个给你官做？』」</p>