但在最终在七家教堂都搜查出了隐藏未交出的珍宝财富。其实几乎所有的教堂多少都有一点私藏，也包括所有的使馆也是一样，只不过这些教堂、使馆只是留藏了一些体积较小、而且价值较高，易于收藏的珍宝；但被搜查出的教堂却是隐藏了大量珍宝、甚致是金银，有的甚致只像征性的交出了一点，其由全都藏在教堂里，那有还被搜出来的道理。
而且和使馆收藏是以珍宝为主，而教堂却是来者不拒，珍宝也要、金银也要、还收藏了大量的铜钱，这也让赶来釆访的达維多特、查妮丝汀十分尴尬，他们俩人虽然不算是教徒，但由于从小受到的教育和文化影响，对教会还是有相当的好感，而且在旧时空里，俩人也会去教堂参加礼拜等仪式活动。而看到教会竟然也参与了抢掠，俩人怎么也不相信，这个时代的教会竟然会是这个样孑。
等全部的检査结束以后，秦铮下令，仍然暂时封锁东交民巷，各国使馆的人员只能在东交民巷内活动，而其他通过了检查的教堂也被暂时限制外出，但被查操出有隐藏的教堂则被查封，主教、教士、教徒都被逐出教堂，被因禁在皇宫里，教堂的一切财产均被人民军没收。而那家对抗人民军的教堂则被下令拆毁，被抓的14个人押送到天津去服刑。
而在随后的几天里，人民军竟然又在皇宫里找到了大量埋蔵在地里的珍宝金银。原来慈禧太后离开北京的时候，曾将一部份自己私人珍藏的宝物、金银分为几处，埋藏在皇宫的地下，其总价值约合1500万英镑，而后来八国联军打进北京以后，曾经在皇宫里挖出过几处，而在旧时空里，等慈禧太后回京以后，将剩余的珍藏取出，仍然大约还合900万英镑。
秦铮熟知历史，自然知道这段史实，也不会将这笔珍宝留给慈禧太后，而对穿越者来说，想找到这笔财富并不难，只用几个金属探测器就行了，结果在皇宫里挖出了好几处埋藏的宝藏。
最终的统计工作足足用去了一个多月的时间才完成，而成果大大超出了所有穿越者的预期，仅白银就达到了9300余万两之巨，而黄金也有200余万两，约合60余吨，而其他的各种远古玉器、唐宋元明的书法名画、宋元陶瓷、珐琅、漆器、金银器、竹木牙角匏、金铜宗教造像以及大量的帝后妃嫔服饰、衣料；另外还有大量图书典籍、文献档案等等，多达10万余件。可谓是金翠珠玉，奇珍异宝，尽聚于此。而且其中还有5000余件珍宝文物受到了不同程度的损坏。
搜查来的白银、黄金自然都被穿越集团不客气的占为己有，但其他的珍宝怎样处理到是一个难题，因为这些珍宝尽管价值不菲，但都是中国的珍贵文物，基本是不可能拿来变现。有的穿越者就建议把所有珍宝全部都运到天津或青岛去，由穿越集团自己收藏，甚致还可以为此建立一个博物馆，供人参观。
但也有人对收藏和建博物馆都持强烈的反对，因为无论是收藏还是修建博物馆，都是一个极为庞大的工程项目，另外在后期的维护、经营也都需要投入大量的人力财力，而现在的穿越集团正是创始之初，百废待兴的时候，所有的人力财力物力都需要投入基础建设，以及发展工业化，实在是没有精力来看护这批珍宝，就算是强行运到天津或青岛收藏，也会由于管理不善造成大量的文物损坏，这样反到是破坏了中华民族的宝贵文物，而且穿越集团最终的目标是取代清廷，建立共和国，等穿越集团取得了政权之后，皇宫肯定会像旧时空那样，改成故宫博物馆，那么这些珍宝文物还是要重新送回故宫中保存，那么反到不如将这批珍宝仍然留在皇宫里。
穿越集团获得了白银、黄金以后，己经得到了足够的发展资金，完全不用将这批珍宝来变现，这样收藏这批珍宝的实际意义并不大，而将这批珍宝在皇宫里，一来是可以得到较好的保管，损坏的机率要小得多；二来也可以显示人民军强行搜查各国使馆，只是为了保护中华民族的宝物，而并不是为了自己的私利，这样穿越集团在道义上就可以占据致高点。
后来穿越集团也为此议题展开了多次讨论，双派各执己见，争执不下，而这批珍宝也一直留在北京皇宫里，并沒有随金银一起运走。最终一直到1901年末，穿越集团新的领导班底正式成立之后，才做出了最后的决定，仍然将这一批珍宝留在北京皇宫里，但穿越集团可以从中挑选一部份，大约是3000件左右，运到青岛收藏，算做是穿越集团的财产。