开完了军事总结会议之后，第二天商毅立刻就开始针对昨天会议上讨论的各种办法，着手进行准备布置。
首先商毅接受了周少桓的建议，让土工坊的工匠们在城墙上修筑石台，以更在清军攻城时，火炮和火铳还能够发挥作用。其实周少桓的这个建议也并非什么独创，在这个时代，就以经有这种上下双层城墙的结构，不过一般只有国都级的大城，或者是边境的重要关隘才会有这种结构的城墙。
穆陵关的城墙宽度约有六米多，城垛墙占了半米左右，经过商毅和工匠还有火枪手在现场测试，将石台的厚度定为八尺，也就是两米五左右，高为五尺，宽度为两丈，两个石台之间，相距一丈。垛墙高六尺，厚一尺，垛口的宽度为二尺。同时在石台的另一侧，还砌一堵两尺高的矮墙，供填弹的士兵坐下。
而高台先用砖石砌边，然后填上碎石沙土，压实之后，在上面覆盖上一层红砖，再砌上垛墙可矮墙。这样的做法不仅比全用砖石砌成省料，而且时间也快得多。
因此在未来，淸军进攻的重点估计还是南城，因此所有的高台也都修在南城，共有三十个高台，每个高台上有六名火枪兵射击的位置，或者可以放下两门火炮。
同时商毅还受到高台的启发，在城墙边上又建了十二座箭塔，为木质结构，高达五丈，分为两层，每座箭塔上可以容纳下六到八名弓箭手，并且有翻板可以通到高台上，但不挤占城墙的位置，就是清军攻上了城墙，也够不到箭塔上。
一但高台和箭塔建成，穆陵关的防守就可以变得立体化起来，防守能力也必然会大大加强。
同时商毅又让木工坊和铁匠坊制做城垛口的挡板。这种挡板两尺宽，四尺多高，主体为木质，在外层蒙上一层铁皮，下瑞开一个二寸多宽，三寸多高的凹口，可以容火枪射击。同时又把城垛口朝外的一面凿出一个小斜坡，一方面是减少云梯倒钩的着力点，另一方面也让火铳有了一个向下射击的斜角。经过测试之后，果然不仅能够起到很好的防护效果，而且对火枪手射击的影响也不大。
不过商毅还是不放心，倒底还是给每一个火枪兵加強了防护。因为上一战中徼获了大量的铁甲，经过简单的修复就可以用了，每个火枪兵都发了一套。火枪兵淘汰下来的铁甲背心，就全部让给新兵用。
再加强城内防守的同时，商毅也采纳了成进的意见，不仅把城外被清军填埋之后的壕沟又挖了出来，同时在壕沟之间，又各自垒起了一道土墙，毎道土墙呈梯形，底宽八尺，顶宽六尺，但高度只三尺，可以有效的阻挡车辆前进，但无法为清军提供遮挡。
规化好了这些工程之后，城中的男女老幼又一次一起动手，开始新一轮修筑穆陵关的防线。
在修筑防线工程的同时，商毅也不忘对士兵进行加紧训练，各队战死的士兵缺口由新兵递补进来。虽然有不少新兵的基础素质还达不到商毅的要求，但现在也没有别的办法，只能依靠老兵来传帮带，让他们在战斗中成长。
而为了避免再次发生，当清兵攻上城头之后，士兵们出现混乱的局面。商毅规定，在清兵还在攻城的时候，守垛口的士兵只许守住垛口，不管其他。攻上城头的淸兵，由后排的士兵来迎战。并且进行了三次针对这一点的模似训练，让士兵们熟悉这种战法。
火枪兵的缺口，则从少年队中来选人补充，因为现在青壮年队的兵源有限，要用到便需要的地方，而弓箭手又需要较强的膂力。只有火枪兵适合少年队的士兵。毕竟尽管火枪兵都装配了刺刀，但白刃战的机会还是比其他兵种要少得多。而且商毅还尽量挑选年纪大一些的少年补充进来，并允许他们在敌军蹬上城墙之后撤下去，不与敌军拚刺刀。
按这样的标准，商毅从少年队中选出了二百名士兵，让他们开始进行火枪射击的训练。之所以选这么多人，主要是因为穆陵关内以经开始自己打制火铳，随着火铳数量的增加，也需要更多的新火枪兵。而且在以后的战斗中，火枪兵也还会阵亡，随时都可能会补充。
就在清军撤军后的第三天，商毅又收到了一个好消息，由孙和鼎设计并监造的新式火铳，以经制造出来，而且一共做出了十二支样品。
孙和鼎制造的这种火铳也是属于火绳枪的类型，同样釆用的是无焊双层管铳结构，但比鲁密铳简单，但射程和威力却比鸟铳要大。经过测试之后，这种火铳有效射程可以达到八十到九十步。破甲可在六十步以外，打破三层甲在五十步右左就行了。等测试完毕之后，罗远斌对这种火铳的性能也是赞不绝口。