清军虽然是彻底退走了，但善后的事情却还有一大堆，就是济南城里的这些物资，虽然以经运走了一批，但留下来的却是绝大多数，要全部运回穆陵关，也是一项大工程。因为济南并不是商毅防区，一但等到朝廷派来官员接手，这些物资归谁所有，还真不好说，毕竟这年头日子都不好过，谁不眼馋白花花的银子和粮食。因此还是要尽快运回穆陵关为好。
好在第二天，穆陵关派来的车队也到达了济南，大大小小一共二百多辆车，加上济南城里的牛马驴等大牲口加起来也有两万多头。士兵一万八千多人，也是人多力量大，而牲口多力量就更大了，终于一次性把所有物资全部都搬完了。不过商毅还是留下杨武丞带一千人守住济南，一面招集流亡逃走的百姓回城定居，一面等待朝廷派官员来接收关城。
布置好了这一些之后，商毅这才率领着大队人马，连同所有的大车小辆离开济南，返回青州的穆陵关。
大军行进沿途都能够看见许多难民，有的三三两两，也有几十人成群结队，商毅派人一打听，才知道他们多数都是本地的居民，因为躲避清军，还进深山老林里，现在听说清军以经撤走了，于是又都出来返回自己的家园。
商毅得知以后，心里也不禁十分感叹，兵荒马乱的年月，受苦的永远都是百姓。因此也让人告诉这些百姓，济南府以经被明军收复，他们可以到济南府去安居，重新开始组建家园。并且又送给他们一些粮食和银两。反正现在腰包丰厚，送出几百石粮食，几千两白银根本算不得什么？
而得了钱粮的百姓自然是对商毅感激万分，也有不少人愿意跟随商毅到穆陵关去定居，恳请商毅收留自己。商毅也没有拒绝，让他们跟在自己的队伍后面一起走。
人马一路东行，走了三四天，进入青州府境內，这时商毅收到了青州府的公文，原来登莱巡抚曾化龙以经到达了靑州府，请商毅到青州府去一趟。
虽然商毅很想马上回到穆陵关，但上司来公文还是必须去应付的，因此将大队人马交给周少桓带领，同时又嘱咐他们一番回到穆陵关之后的事情安排。然后自己只带了段鹏等十二名护卫人员，赶到青州府。
一天之后，商毅到达了青州府，在城门正好遇到两位认识的官员，韩志和肖文军，他们是奉了曾化龙的命令，来迎接商毅进城的。
熟人相见，自然是一番寒宣，而且这一回商毅又立了一次大功，淸军又退兵回去，商毅升官也是指曰可待，两人都算不清楚，商毅应该升到什么官了，参将、副将、总兵，都有可能。因此也对商毅显得十分热情。
于是商毅就在两人的陪同下，来到了青州的知府衙门。这时登莱巡抚曾化龙，青州知府孟宏恭为首的一干登莱青州地区的三十余名文武众官员们都以经汇聚一堂，等待着商毅的到来。
进了府衙之后，商毅首先向曾化龙行礼，道：“穆陵关千总司千总商毅，参见巡抚大人。”
曾化龙亲自下座，把商毅扶起来，呵呵笑道：“商毅，不必多礼了，你这一次可以立下了不少大功，本官以经如实向朝廷上奏，相信很快朝廷就会有旨意下来，到那时你可就不在是一个小小的千总了。”
商毅忙道：“这些许小功，全是巡抚大人指挥有方，三军将士齐力协心杀敌，卑职不敢自居其功。”一指孟宏恭，道：“特别是孟知府，这次收复济南府，也幸亏有孟知府的大力协助，支援了不少物资不说，还调动了两千人马。”
孟宏恭听了，心里也大为放心，他生怕商毅在曾化龙面前说出青州兵在济南府中犯下的劣绩，好在商毅不但没有说，相反还有曾化龙面前直言，收复济南府是得到自己的物资人马协助，这样一来，自己也能占一份功劳。因此对商毅也十分感激，忙道：“那里那里，收复济南还是商千总出力最大，我们青州府只能提供这些小小帮助了，说来实在是惭愧。”
接着曾化龙又一一向商毅指引了其他官员，这里面一多半商毅都不认识，但也有几个熟人，如胶州守备刘天锡、威海卫指挥马汉福，大嵩卫指挥高天，寻山后所千户杨明远和王徐寨前所千户冯志刚等人，而在见礼的时候，这几个人也对商毅表现的十分亲近，拍肩搭背，以显示自己和商毅是老交情相识了。
而其他的官员见商毅不过是一个小小的千总，却如此受巡抚曾化龙的赏识，而且眼看着就要升官，这次升官还一定不会小，也不禁都看着商毅，目光中又羨又嫉。