等朱聿键的信送到杭州的时候，商毅早己经知道了江西的局势，并且己经做出了应对的布置。
看来郑芝龙还是要走上向清廷投降这条路去了。当然对这一点，商毅也是有所准备。不过商毅心里也清楚，从郑芝龙的本意来说，并不是想和当初的吴三桂一样，完全倒向清廷，准确一点说，是希望和清廷达成某种协议，就好像当初接受明朝的招安一样，依然保持着自己的独立性，并且继续让自已占据福建和广东之地。
因此郑芝龙选择降清，原想找为自己以及家族在这个乱世中找一条根本出路，但清廷并不是这样想的，而是将招抚视为顺利拿下福建的一种手段，结果在另一时空里，郑芝龙在降清之后，反而被挟持北上，在北京度过了十几年的软禁岁月，最后仍然被满清处死。
郑芝龙的错误就在于，他对清廷沒有清楚的认误，说简单点，他把淸廷也当明朝一样对待了，完全沒有意识到，这时的清廷是否已经具备统一全国实力，在此暂且不论，但和腐败的明朝完不全，至少已经把统一天下当作自己的目标，因此想保住自己的地盘和势力，必须破釜沉舟，与清朝决一死战。说白了想让对手坐到谈判桌前，也是要有足够实力的。
当然郑芝龙的选择，除了不看好隆武政权有可能的作为外，也足过分信任同乡洪承畴，以及洪所代表的清朝，也充份表现出郑芝龙在政治上的幼稚与短视。过于重视自己的“海商资本利益”，没有想到在这个大时代中，只能竭尽全力去参与天下的角逐，连弃权的资格都没有。
不过现在事情己经很难更改了，商毅只希望郑芝龙能够充份的警惕性，就算降清，也不要轻信淸廷的承允，被清廷挟持北上，因为如果是郑芝龙坐镇福建，就不会轻易和自己为敌，这样自己的压力也就会小一些。
于是商毅也立刻给郑芝龙写去了一封信，以十分严厉的口气指责郑芝龙对清军釆用的不抵抗政策，违反了浙江、福建达成的联手抗清的协议。
但在此之前，商毅早己派了驻守在严州段鹏立刻带领特种兵旅出发，去占领仙霞岭，如果仙霞岭被清军所占，就立时复夺仙霞岭。同时又从第一军里抽出了一个师，交给段鹏指挥，驻守处州府，保护浙江西南，与江西、福建交界的位置。
段鹏接令之后，也率军立刻从严州出发，赶向仙霞岭。但终于是因为郑芝龙有意放清军入福建，故意撤军，结果让淸军不费一兵一卒，就攻占了仙霞岭。因此段鹏也立刻下令全旅，准备战斗，复夺仙霞岭。
仙霞岭位浙江、江西、福建三省的拆冲要路，地势险要，山岭重叠，岭上山路有三百六十级，二十八曲，长约二十余里，崇峻雄伟，夙称天险。素有“东南锁钥、八闽咽喉”，为东南的兵家必争之地。
段鹏也知道仙霞岭的重要性,这是关系到浙江省西南的安全,因此必须夺下仙霞岭。而要夺下仙霞岭，就必须改下岭上的仙霞关。
仙霞关是建在仙霞岭上的一座关隘，是与位于四川广元的剑门关，于河南西部灵宝的函谷关，山西省代县的雁门关齐名的中国四大古关口之一。一共有四道关门，东北和西南各两关门，皆以条石砌成，高一丈二尺，宽九尺，均建在两山夹峙的危岩陡壁之隘口中，都是易守难攻之地。不过正是由于仙霞关地势险要，易守难攻，因此清军在这里布置的防守兵力不多，每座关门只有三百人驻守，其中各有一百火铳兵，另外在关里还有六百预备军。
商家军是从东北方向仙霞岭发动进攻的，虽然仙霞岭的山势陡峭，但特种兵旅都是经过了严格训练，爬山也是其中之一，山道到是并难不住他们。尽管清军在山道上设下了三处驻点，但也都被商家军一一攻破，因为这次在山地作战，商家军所带的火炮不多，而且都是小炮，打得不远，因此线膛枪的超远射程，发挥了相当大的作用。
东北方的第一关的正面宽度只有二十多丈，商家军的进攻一开始，就遭到了清军的火力拦截，清军居高临下，以火铳、弓箭封锁了入向关城的山路，给进攻的商家军造成了严重的杀伤。
尽管如此，商家军的士兵们还是冒前枪林箭雨，从险峻的山路止，向第一关发动猛攻，而狙击步兵则在后面寻找着躲在城垛口的清兵，一个一个的进行射杀。尽管能够参与战斗的人数不多，但战斗却进行得异常激烈。
而段鹏一面下令从正面强攻，一面也命令两个连的士兵，从左右爬山绕到第一关城的侧翼，去发动进攻。果然在一个时辰之后，有一个连的士兵爬上关城左侧的山峰，然后直接从山顶冲下来，绕到第一关的背后，向清军发动进攻。