虽然德川家光下令关闭商馆，扣压到港船只，抓捕中国商人，但经过初步审问，发现这只是普通商人，在商馆里也没发现别的什么东西，更没有发现丰臣氏做乱的证据。因此徳川家光也有些犹豫起来，难到这真的就是普通的经商吗？
而一直等待机会的岛津光久立刻出头向德川家光建议，事情到了这一步，有进无退，应该马上出兵，进攻琉球，然后威逼杭州，迫使商毅交出丰臣氏余众一干人。并且极力夸大中国的內战局势，现在商毅正在全力抵抗淸军，根本无力顾及其他，在琉球的驻军也不多，而且都是从欧州招募来的雇佣兵，就也说明商毅抽不出自己的兵力驻守琉球了。因此这正是一个难得的好机会。如果等商毅和清军分出了胜负，可就不好办了。
徳川家光对日本以外的土地到是没有什么野心，也不想和中国全面开战，但他对丰臣氏的余众确实颇为忌殚，而且对中国的局势也有一定的了解，知道在去年明清之间展开了一场激战，双方的损失都不小，现在战事暂时停止，而维护丰臣氏余众的明朝将军商毅，是南方抵抗清军的主要力量，现在驻守在长江一带，而中国进入了南北对持的局面。
根据掌握的这些情况，德川家光也判断，现在虽然战事停止，商毅要全力抵抗淸军发起进度进攻，因此确实没有余力和日本作战，岛津光久的建议有很大的成功把握。
随后德川家光又和自己手下的重臣酒井忠胜，松平信纲，阿部忠秋等人商议，也都认为此议可行。于是立刻下令，让萨摩藩为先锋，首先向琉球发动进攻，同时又调动各地大名的人马，准备大举登陆琉球，以兵势逼迫商毅交人。如果商毅还不肯交人，那么就甴琉球进攻杭州或是台湾，进一步施压。
领命之后，岛津光久也不禁大喜过望，自从战败之后，他就在为复夺琉球做着准备，在藩内招集了五千士兵，进行严格训练，同时又咬紧牙关，打造战船，从荷兰人、葡萄牙人那里购买了千余支火枪，就是等着这一刻。因此也立刻回藩，招集家臣部众，准备夺回琉球。
这一次出战琉球，萨摩藩将出动八千左右的兵力，新建jūn_duì 将全部出动，同时还动用船只六十余艘，藩主岛津光久也将亲自为全军的主将，现存的家老新纳原忠和他的儿子新纳四郎次源，家臣桦山久孝、长裕义行、平田宗次郎等人，还有岛津光久的几个弟弟：老六町田忠尚，老九岛津久雄、老十三伊势贞昭，等人也都悉数出战。
现在的萨摩藩在日本只能算是二流大名，能够抽调出这样规模的兵力，也差不多就是萨摩藩的极限了，可以说为了夺回琉球，萨摩藩己经是倾尽全力，孤注一掷了。
而在出兵的同时，岛津光久又下令先其潜入琉球的家臣桦山久孝开始在琉球发动突袭。
桦山久孝是在二个月前带领三百士兵潜入琉球，因为这时琉球的日势力正是急聚膨胀的时候，因此有他们掩护，琉球全国对此一点察觉也没有。而桦山久孝的到来，也使琉球的亲日势力全部欣喜若狂，大有终于等来组织之感。
琉球亲日势力手里的人手加在一起约有一千五六百人，收到了岛津光久的命令之后，桦山久孝也立刻开始行动，就手头上的这些人，他当然不敢去进攻西班牙雇佣军的军营，但对首里城却毫无惧畏，因此首先对首里城展开进玫。
就在八月十七日夜，桦山久孝率领着萨摩士兵和琉球亲曰势力，与琉球王朝中的亲日派里应外合，袭击了首里城。而琉球朝廷对此毫无察觉，因化首里城里也一点防备都没有，结果被萨摩军一鼓作气杀进了首里城，包围了王宫，一夜之间，琉球王尚贤以及琉球王室全部都成了萨摩军的俘虏。王室的财富也全部都成了萨摩军的战利品。
虽然首里城里还有二三千余名士兵，但根本就不是萨摩军的对手，两军一经交战，就被萨摩军打了一个落花流水，大部份都投降了萨摩军，也有小部份逃出了首里城，去向军营里的西班牙军送信。
在控制了首里城之后，萨摩军暂时还没对琉球的王室成员下手，但对琉球朝廷中亲明派的大臣可毫不客气，只要是被亲日派指认为亲明派的，什么话都不问，直接杀死，而且还是一家全部杀光。