商毅等人进入北京之后，当然是入主到紫禁城里居住。因为北京的紫禁城和南京紫禁城的格局和名称几乎是完全一样，因此每人居住的地方，也和南京一样。
虽然清廷入关之后，对北京紫禁城进行了一些修改，但由于清廷进入北京的时间并不长，因此紫禁城的格局也并没有大动，只是把李自成进北京之后破坏的地方进行了修膳，基本使北京紫禁城完全恢复的原貌，相比之下，南京的紫禁城还有少数的损坏宫殿并没有被修复，因此北京紫禁城看起来到显得更为整齐一些，而这时紫禁城里也早己经扫得干干净净。由其是供商毅、叶瑶瑱、亚莉桑徳拉三人居住的乾清宫、坤宁宫和咸福宫，还有御书房里，也全部都布置一新，静待他们入主居住，虽然商毅在北京的日孑里未必就住在乾清宫里。
在清廷投降之后，福临等皇族成员在皇宫里还住过一段时间,然后根据南京內阁的命令,将他们迁移到北京郊外的劳改农场里，参加劳动改造去了。当时毎人准许带两名随身伺候的太监或宫女，而其他的太监宫女则全部留在皇宫里，另行处理。
清廷的皇宫机构和制度都是继承的明制，虽然清廷入关只有七年多的时间，但皇宫里的二十四监机构全部都设置整齐，太监的人数虽然也没有明朝那么多，但在灭亡之前，也有八九百人，而宫女也有七百余人。而跟据內阁的命令，所有的太监宫女按照自愿的原则，愿意出宫回家的，一率放行，并且发给一定的路费。因此也走了一大批人。现在皇宫里还有太监七百六十三人，宫女三百七十一人。
相对来说，太监出宫之后，基本没有什么出路，因此离开的人较少，而宫女的出路就多一些，因此大多不愿老死在宫中，离开的较多，但留下来都是满族的宫女，出宫也无处投靠，只好都留在宫里。而还有少数是和太监结成对的，不想扔下对方离开。而留在皇宫里的人，仍然各司其责，付责皇宫里曰常维护工作。
成进知道，商毅是要废除太监制度的，因此也特意安排，不让太监在乾清宫、坤宁宫、咸福宫、御书房里当值伺候。而商毅、叶瑶瑱、亚莉桑徳拉也都带了自己随身的待从宫女，并不缺少伺候的人手。
在皇宫里安定下来之后，由叶瑶瑱付责指挥乾清宫的布置事务，亚莉桑徳拉则陪着父母，在皇宫里游玩，而商毅在御书房里招见了堵胤锡和北京军区的司令部成员。讨论对蒙古的作战方案。
自从中华军在北京效外击败了硕塞带领的蒙古骑兵之后，成进也和北京的情报司人员合作，向北京地区派遣了大量的情报人员，收集蒙古方面的消息，因为中华军也没有关闭张家口这个对蒙古的贸易口，因此也可以收集到大量后有用信息。
这时逃到蒙古的硕塞、博洛、岳乐、瓦克达、勒克德浑等五人都己经初步在蒙古站稳脚，硕塞、博洛、岳乐占据了察哈尔；而瓦克达、勒克德浑占据了归化城土默特，双方也暂时形成均势。但蒙古六盟也并不是全部都对他们持支持态度。虽然清廷的两个势力联合招集蒙古六盟聚议过一次，但并沒有达成任何实质性的协议。
因为清廷在蒙古设立盟旗制度的时候,就是想要分化蒙古的各方势力,不使一方独大，因此才将蒙古分为六盟，而并不设统一管理蒙古的官员，而且就是在各盟内部，也不是铁板一块，盟主只是付责总理全盟的事务，但对盟内各旗内部的事务却无权干涉。这样一来蒙古六盟实际就是一盘散沙，根本就捏合不到一起去，当然也就无力与清廷相抗衡了。
虽然这样的盟旗制度确实是有利于清廷对蒙古的统制管理，但在现在急需要蒙古支援帮助的时候，却成了一个杯具。首先是蒙古六盟谁也不服谁，沒有统一的指挥，尽管清廷的两方余势都认识到这一点，因此也都想指定由与清廷关系最近密的哲里木盟担任总盟主，但却遭到了其他五盟的强烈反对。而且反对的理由也正当，和清廷的祖制不同，但在私下里谁心里都明白，凭什么让哲里木盟来担任总盟主。
由其是锡林郭勒盟和乌兰察布盟，甚致危胁如果一定要哲里木盟来担任总盟主，自己就马上退出去。因此最后只能决定不设总盟主，而是成立六方会谈，以后所有事情都由六方一齐商议决定。