在刘玉波谋划辽东，剑指南洋之际，北京紫禁城乾清宫，端坐着一位眉头深锁的男子，头戴翼善冠，身着四团龙袍，腰缠透犀腰带，正在对着一份奏折思索。因天气转凉，大殿内又阴森幽暗，通风不佳，殿内众侍者也只待了一个时辰不到，便各自冷的瑟瑟发抖。
此人正是被后世褒贬不一的明朝皇帝万历，在他的继位的前十年奋发图强，在张居正的辅佐下，使明王朝的经济得到了空前的繁荣，在江南地区已经出现了资本主义萌芽，史称万历中兴，后由于三大案的等一系列因素，近三十年不理朝政。饶是如此他也始终魁柄独持，从这一点说，绝不是一个庸人之辈。
而现在所困扰的他的是一件事正和刘玉波有关，今年九月二十一日，户部奏:八闽为大省，产盐最多，盐课仅二万二千余两，似属太少。前福建巡按徐鉴说该省额派三万七千五百六十五引，而盐行六帮引少帮多，以致私盐横行。议增二万六千七百七十五引，每年解部银七千三百三十九两，此宜成为定议。又查漳州、泉州、兴化三府，原为行盐之地，近则不买食官盐，置国课于不顾。皆有违祖宗制度，请严行查明其原因。
而这一次核查福建盐课却把刘玉波这条大鱼吊了出来，刘玉波掌握台湾后，最先发展的就是盐业，现下台湾有八大盐场产出极大，为了扩展收入，刘玉波自然将主意打到了明朝身上。众所周知历朝历代盐业都是国家收入的重要来源，所以一直有国家把持，这导致走私私盐的利润极大，刘玉波和南方沿海诸省的商人签订了协议，以低于明朝私盐的价格将盐卖给他们，虽然价格低但还是有的赚的，此项每年可以给刘玉波带来八十多万的收入，同时又和南方沿海的大族搭上了路子，倒也算收益极大。
不过刘玉波没想到的事，这他又在一次出现在已经快要将他遗忘的万历眼中，万历作为一国之君而且又怠政，收益能入他法眼的人物是少之又少，而这刘玉波已经是第三次入他法眼了，第一次是福建巡抚指出刘玉波召集灾民虎踞海外，鉴于当时刘玉波没有做出格的事情便不了了之，第二次是今年的北方移民事件以及朝鲜方面得来的情报，都确认是这个远在南方的刘玉波做出来的，朝廷中有不少人已经看出了刘玉波野心不小，也开始对他稍加限制，不过刘玉波与沿海的世家大族关系盘根错节，又发生了震动朝野的“挺击案”，风波未了的山东、畿辅二地大旱，刘玉波一事再次不了了之了。
而这一次刘玉波再次出现在万历眼中，不知万历打算怎么做呢？是事不过三，还是下定决心铲除刘玉波？只见万历眉头越锁越深，最后万历终于批复了，写上知了二字。
万历不是不知道这是绥靖政策，但也没有办法，今年的确是个多事之秋，内有南北各地灾害沓至，民心浮动。四月十九日，河南舞阳、泌阳、遂平等县，饥民数百人纷纷起事；五月，江北、山东大蝗，积地尺许，流人集淮上三十余万。同年六月二十日，山东武安饥民三千人发动起义，杀死县主簿孙光耀；六月二十八日，河决河南祥符朱口，陈、杞、睢、柘城诸州县，皆受其害；十月，兵科给事中赵兴邦为九边请饷，说:今日一二百万两，抚之而有余;如等到将来边境问题严重，即使是动用几千万，仍然不足以安边。内库银三十万两及户、工二部银八十万两支边。